Argumento



El desarrollador Ed Boon describe el juego como una necesidad de volver a contar los acontecimientos de los juegos anteriores, especificamente de los tres primeros

...La historia comienza con Raiden, justo cuando está a punto de ser asesinado por Shao Kahn en los eventos que suceden después del Armagedón. En un último esfuerzo, envía un mensaje a sí mismo en el pasado, en la era de "Mortal Kombat", el primer juego. El resto de la historia muestra al Raiden del pasado tratando de entender las visiones y los mensajes que recibe de sí mismo en el futuro y trata de prevenir los eventos que conducen a la destrucción de todas las realidades.

Durante los acontecimientos del primer torneo organizado por Shang Tsung, una versión anterior de Raiden ve visiones de futuro, la cortesía del amuleto se ha roto, Raiden llega a la conclusión de que Liu Kang debe ganar el torneo y salvar el Earthrealm del Outworld. Aunque Liu Kang tiene éxito, el amuleto de Raiden continúa deteriorándose, una señal de que los acontecimientos futuros permanecen sin cambiar. Decepcionado con la derrota de Outworld, Shao Kahn ordena ejecutar a Shang Tsung pero cede cuando el hechicero sugiere la celebración del segundo torneo en el Outworld. Raiden intenta cambiar la línea del tiempo mediante la sustitución de Lui Kang por Kung Lao, el ganador del primer torneo del Outworld, como el campeón del segundo torneo. Shao Kahn, sin embargo, mata a Kung Lao después del combate; Liu Kang toma represalias y hiere de muerte a Shao Kahn.

Sanado por el hechicero Quan Chi, Kahn entra en una alianza con el Netherrealm e invade el Earthrealm. Raiden y Liu Kang intentan detener a Kahn, junto con luchadores como Nightwolf, Kurtis Stryker, Kabal, Jax, Sonya Blade, Johnny Cage, Kitana, Jade, Smoke y Cyber Sub-Zero. Sin embargo, muchos de sus aliados mueren a manos de Sindel, la esposa resucitada de Kahn. Nightwolf, no obstante, se sacrifica y mata a Sindel.

Raiden enfrenta a Quan Chi y descubre lo de la alianza con Kahn, Raiden recuerda el mensaje «él debe ganar» y se da cuenta de que habla de Kahn ya que si el fuciona los reinos los Dioses Antiguos lo castigarían por violar el «código del Mortal Kombat». Liu Kang sin embargo, culpa a Raiden por la muerte de sus aliados y la invasión de Shao Kahn. Al tratar de cambiar el futuro Raiden accidentalmente hiere de muerte a Liu Kang. Raiden se rinde ante Shao Kanh, pero Shao Kanh lo ataca y se burla de él y de los Dioses. Los Dioses deciden intervenir y le dan a Raiden el poder de matar a Shao Kanh, como castigo por haber violado el código de Mortal Kombat. Después de matar a Kahn, Raiden promete reconstruir el Earthrealm con los únicos supervivientes, Johnny Cage y Sonya.

Quan Chi revela que es un servidor de Shinnok, quien tiene la intención de aprovechar el caos y la eliminación de Kahn para conquistar tanto el Earthrealm como el Outworld, en el nombre del Netherrealm.